把毛囊单位移植至秃发区，需要先造出针样大小的切口放置毛囊单位。可使用小手术刀切开恰当深度的切口放置移植毛囊。在毛发重建术中常常用到毛囊单位组。而在发际线上种植时常种植单个毛囊单位。在发际线后面种植含有1或2根头发的毛囊单位，往后面种植，则为了增加头发密度，常种植含有3和4根头发的毛囊单位。在发际线后面的移植毛囊单位密度也需要增加。为了确保种植后的发际线看起来自然美观，手术医生需要根据头发生长的角度和方向把握毛囊种植的位置。毛发移植术后几天，移植区的切口会自然愈合。